La CMI de benzylpénicilline permet de préciser si l'on a ou non à faire à une souche de sensibilité diminuée aux bêta-lactamines, définies par une CMI de benzylpénicilline > 0,06 mg/L, représentant environ 35% des souches, en France (cf. Rapport d'activité 2008 du Centre National de Référence des Pneumocoques) ; le mécanisme en cause est une modification de cible (PLP) qui réduit l'affinité de l'antibiotique pour celle-ci ; dans un tel cas, il faut mesurer la CMI des bêta-lactamines potentiellement les plus actives (amoxicilline, céphalosporines de 3ème génération), par exemple par bandelette E test , afin de choisir une bêta-lactamine ayant une faible CMI.