Mycologie Médicale
Cours

Classification

Position dans le monde vivant
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Opisthoconte

  • Propulsion par un flagelle (situé à l’arrière)

  • Rapprochement moléculaire reposant sur plusieurs gènes et synapomorphies

    • Chitine

    • Réserves carbonées sous forme de glycogène

    • Codon UGA = stop dans la mitochondrie

    • Thymidylate synthétase et dihydrofolate réductase séparées

    • Facteur d'élongation eucaryote 1A à intron

Synapomorphies

  • Caractère dérivé commun à un ou plusieurs taxons

  • « Homologie »

    • Organes

    • Caractères biochimiques

  • Ex. de synapomorphies: chez Monocots

    • Cotylédon unique

    • Racines fasciculées

    • Nervures parallèles

    • Absence de bois

Les Eumycota ou Fungi

Phylogénie … Δ … encore discutée …

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Les Ascomycotina
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Les Basidiomycotina
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Principaux pathogènes

Zygomycota

  • Absidia, Mucor, Rhizopus, Rhizomucor, Cunninghamella, Saksenia, Morteriella…

  • Conidiobolus, Basidiobolus

Ascomycotina

  • Saccharomyces, Zygosaccharomyces, Pneumocystis

  • Nannizzia, Arthroderma; Ajellomyces; Emonsiella; Aphanoascus

  • Eurotium, Emericella; Talaromyces;

  • Microascus; Pseudoallescheria

  • Ceratocystis

  • Nectria, Gibberella

  • Claviceps

Basidiomycotina

  • Filobasidiella, Filobasidium

  • Rhodosporium

Ancienne classification: ex-Deutéromycètes

  • Coelomycètes: … Phoma

  • Blastomycètes: ... Trichosporon

  • Hyphomycètes mucédinées: ... Coccidioides

  • Hyphomycètes dématiées: ... Alternaria, Cladosporium, Curvularia, Dreschlera, Exophiala, Madurella, Fonsecaea, Scedosporium, Wangiella

DéfinitionDéfinition des stades sexués

  • Stade anamorphe

    • Ne présentant que la multiplication asexuée

  • Stade téléomorphe

    • Reproduction sexuée entre deux anamorphes de polarité complémentaires (MTA & Mtα ou MT+ & MT-)

  • Stade holomorphe: champignon « complet »

    • Champignon présentant toujours sa phase sexuée

  • Synanamorphe

    • Présentant plusieurs morphologies anamorphes

  • Syntéléomorphe

    • Présentant plusieurs morphologies téléomorphes

Exemples
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image08

Appareil végétatif = thalle

  • Champignons filamenteux: mycélium formé d'hyphes

    • Coenocytique ou siphoné → Zygo

    • Cloisonné ou septé→ Dicarya

  • Champignons levuriformes: thalle unicellulaire

    • Cellules isolées

    • Parfois pseudomycélium

Thalle coenocytique
image09[Zoom...]

  • Siphons

  • Diamètre irrégulier

  • Noyaux nombreux

  • Pas de septums sauf...

Exemples en histologie
GG
GG
HES
HES
Calcofluor
Calcofluor
Thalle septé: Ascomycotina
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  • Hyphes cloisonnées

  • Diamètre fin régulier

  • Plusieurs noyaux

  • Septum à pore central

Un Aspergillus
GG
GG
Un dermatophyte
Calcofluor
Calcofluor
Thalle unicellulaire
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  • Cellules dissociées, isolées: globuleuses, ovoïdes, cylindriques…

  • Pseudomycélium

Un Cryptococcus
GG
GG
Un Candida
PAS
PAS
Techniques de coloration

  • Hématoxyline, Eosine… Safran… H&E, HES, Hémalun

  • Imprégnations argentiques: GG, GMS → polysaccharides

  • Fuchsine, hématoxyline

    PAS: acide périodique de Schiff (en fr.)→ polysaccharides, mucopolysaccharides

  • Fluorochrome: Calcofluor®→ cellulose et chitine

Polymorphisme des champignons

Morphologie variable

  • Habitat d'origine: dans la nature, sur le sol

  • En milieu de culture in vitro: 20-30°→ forme filamenteuse

  • En conditions de vie parasitaire: in vivo homme, animal

  • En culture in vitro à 37°→ forme levure

Effet du milieu de culture

Milieu d’isolement

  • Milieu de Sabouraud + antibiotique

  • Milieu au malt

  • Milieu de Czapek

Milieux d'identification sélectifs

  • Eau gélosée

  • PC

  • PCB

  • RAT

  • Lactrimel...

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