En présence d'un 1er épisode chez une femme adulte non enceinte de moins de 65 ans sans pathologie associée, l'ECBU n'est pas indispensable.
Le diagnostic doit être confirmé par le test des « bandelettes urinaires ».
Pour tous les autres cas d'infections (cystite chez les autres femmes, enfants et hommes, cystites compliquées, récidivantes, pyélonéphrites, prostatites), l'ECBU est demandé.