Diagnostic biologique de l'infection grippale
Le plus souvent , l'infection grippale ne nécessite pas de confirmation virologique : elle et prise en charge en ville, le diagnostic est clinique et épidémiologique. En effet, à partir du moment où la circulation des virus grippaux est annoncée en France, tout syndrome grippal est une grippe jusqu'à preuve du contraire.
Nous verrons d'abord les les outils dont nous disposons pour détecter les virus grippaux
Ensuite, nous verrons à quelles occasions ces outils sont utilisés.
Prélèvements nécessaires :
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chez les adolescents et les adultes : écouvillonnage de nez,
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chez les enfants : aspiration rhino-pharyngée,
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liquide de lavage broncho-alvéolaire. Cet examen est réservé aux personnes hospitalisées en réanimation qui sont intubées.
Les prélèvements doivent être acheminés rapidement au laboratoire, éventuellement, ils peuvent être conservés à +4°C.
Outils de diagnostic utilisables dans le cadre des infections grippales
Nous pouvons réaliser :
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Tests unitaires rapides,
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IFI directement sur les échantillons respiratoires,
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Isolement viral en culture cellulaire + IFI,
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Recherche du génome viral par RT-PCR.
Tests rapides unitaires
Ils sont utilisés en chez les médecins libéraux.
Les inconvénients de cette technique sont :
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L'immunofluorescence indirecte directement sur les échantillons respiratoires
Détection du virus directement dans l'échantillon respiratoire. On peut pratiquer le typage grippe A/B grâce à des anticorps monoclonaux spécifiques. Les résultats sont obtenus en 2-3h. |
Cette technique est
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rapide,
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peu coûteuse,
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simple à réaliser.
Elle peut cependant manquer de sensibilité.
Isolement et identification du virus en culture
A partir d'un échantillon respiratoire, dépôt sur les cellules de rein de chien (cellules MDCK) qui sont les seuls cellules permettant d'isoler les virus grippaux.
Incubation pendant 48h à 72h à 37°C.
Il n'y a jamais d'ECP lors de l'isolement de la grippe : au bout des 72h, les cellules en culture sont récoltées et une IF est réalisée.
Cette technique est réservées aux laboratoires de virologie. Elle est :
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très sensible,
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très spécifique (grâce à l'IF),
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peu coûteuse,
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permet l'étude des souches : typage A/H N, B par séquençage, variabilité des souches ...
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le délai de rendu des résultats est trop long pour des tableaux cliniques bénins.
Recherche des génomes viraux par RT-PCR
À partir d’un échantillon respiratoire, il faut réaliser
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Cette technique permet :
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Gain de sensibilité,
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Gain de spécificité,
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Typage A/B possible en utilisant des sondes spécifiques A ou B, voire la différenciation des sous-types viraux.
Cependant, cette technique
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est coûteuse,
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nécessite un équipement de laboratoire particulier, du personnel spécialisé,
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ne permet pas l'étude des souches virales infectieuses.
Diagnostic sérologique de la grippe
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aucun intérêt en pratique quotidienne
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utilisé pour les études épidémiologiques
Stratégies de diagnostic de la grippe
Les virologues peuvent être confrontés à plusieurs cas de figure :
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détecter le début de l'épidémie de grippe chaque année à l'automne,
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diagnostiquer une infection grippale chez un sujet fragilisé.
Détection du début de la circulation des virus grippaux
A partir de prélèvements respiratoires simples (aspirations rhino-pharyngées, écouvillonnage nasal), on réalise le plus souvent une IF directement sur l'échantillon. Si l'IF est négative et le tableau clinique évocateur, on peut répéter le prélèvement et l'IF ou mettre le premier échantillon en culture.
Diagnostiquer une infection grippale chez un sujet fragilisé
Cette fois, on est face à des patients soit en bas âge, soit porteurs de pathologies chroniques, soit présentant un tableau clinique sévère.
La rapidité du diagnostic peut être importante pour la prise en charge du patient.
Les prélèvements réalisés seront :
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aspirations rhino-pharyngées pour les petits enfants,
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écouvillonnage nasal chez les adultes,
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liquide de lavage broncho-alvéolaire si le patient est intubé.
Les tests réalisés seront au choix et en fonction de l'équipement des laboratoires :
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IF directement sur l'échantillon,
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recherche du génome viral par RT-PCR.
